forgemia.inra.fr / sk8 / sk8-apps / metexplore
sk8/sk8-apps/metexplore/samba
SAMBA (R) est une interface pour analyser les résultats de sampling de réseaux métaboliques générés à partir de SAMBApy sous Python. Elle est composée d'une une partie comparaison (calcul de différence) et une partie visualisation graphique des résultats. https://samba.sk8.inrae.fr/
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sk8/sk8-apps/metexplore/champ
https://champ.sk8.inrae.fr CHaMP is an RShiny app that loads a list of compound masses from twin-peaks analysis, and build a mass difference network from which is extracted the connected component containing a mass of interest. It provides a network visualization of the sub-network that encompass potential metabolic and spontaneous reactions that leads to degradation/metabolization products.
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